A UPF informa  que a instituição não irá encerrar as atividades de seu Zoológico. Destaca, que ao longo dos anos o local passou por diversas adequações e a Universidade fez pequenos investimentos. Em 2010, quando a atual gestão assumiu, encontrou algumas pendências.

Em 2012, ao tomar conhecimento das dificuldades relatadas pela coordenação do Zoológico e pela direção do Instituto de Ciências Biológicas, unidade a qual ele está vinculado, a Reitoria participou de reunião na Procuradoria Federal, com o representante do Ibama em nível estadual. Na ocasião, a UPF apresentou cronograma de investimentos, visando atender os itens apontados como irregulares.

O documento foi apresentado, aprovado pelo Ibama e chancelado pelo procurador federal. Considerando que o atendimento das questões apontadas pelo Ibama exigem investimentos, a UPF comprometeu-se em aplicar o valor de R$ 120 mil reais, a cada ano, para executar as obras indicadas no cronograma durante o período de oito anos. Em 2013, por exemplo, foram investidos aproximadamente R$ 150 mil reais. 

A UPF afirma que está cumprindo o cronograma estabelecido para a execução das melhorias, nos termos definidos junto com o Ibama e de conhecimento da Procuradoria Federal.